{"id":3823,"date":"2026-06-15T12:12:29","date_gmt":"2026-06-15T04:12:29","guid":{"rendered":"https:\/\/pm11.corsivalab.xyz\/sciencewerke.indo\/?p=3823"},"modified":"2026-06-15T12:52:34","modified_gmt":"2026-06-15T04:52:34","slug":"pojok-halal-sciencewerke-scientific-halal-investigation-jilid-2","status":"publish","type":"post","link":"https:\/\/pm11.corsivalab.xyz\/sciencewerke.indo\/pojok-halal-sciencewerke-scientific-halal-investigation-jilid-2\/","title":{"rendered":"Pojok Halal Sciencewerke: Scientific Halal Investigation (Jilid 2)"},"content":{"rendered":"

Masih Bingung Menentukan Target DNA yang Mau Digunakan dalam \u201cPengujian Halal\u201d? Mau Tahu Apa Kata SNI Kita?<\/strong><\/p>\n

\"sciencewerke\"<\/figure>\n

 <\/p>\n

Jilid 2: Pemilihan Target DNA dalam \u201cPengujian Halal\u201d pada Pengujian Molekuler.<\/strong><\/p>\n

Oleh: Imam Hardiman, MSc.<\/p>\n

 <\/p>\n

Penggunaan Molekuler dalam \u201cPengujian Halal\u201d<\/strong><\/p>\n

\n
\n

Pada artikel sebelumnya\u00a0Pojok Halal Sciencewerke Jilid 1<\/a>\u00a0Kita telah membahas alasan dibalik penggunaan pendekatan molekuler berbasis DNA dalam \u201cpengujian halal\u201d atau lebih tepatnya adalah pengujian cemaran zat-zat yang diharamkan (red: seperti porcine\/babi dan hewan non-halal lainnya seperti karnivora dsb.). Kemampuan metode PCR\u00a0(Polymerase Chain Reactions)<\/i>\u00a0dalam memperbanyak dan mendeteksi DNA target sangatlah membantu dalam pendeteksian cemaran non-halal pada sampel yang akan Kita ujikan. Hal ini didukung oleh target uji Kita yang merupakan makhluk hidup yang mana memiliki identitas atau \u201cKTP\u201d alamiahnya yang berupa untaian DNA.<\/p>\n<\/div>\n

\"\"<\/center>
\n
<\/p>\n

Gambar 1 Instrumen Real-Time PCR CFX Opus Deepwell Real-Time PCR System #17007991<\/p>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

 <\/p>\n

<\/center><\/div>\n<\/div>\n

Sehingga penggunaan metode PCR (red: PCR konvensional,\u00a0real-time<\/i>\u00a0PCR (qPCR) maupun\u00a0digital<\/i>\u00a0PCR (dPCR)) bisa diimplementasikan juga dalam membantu pengujian zat-zat non-halal tersebut guna mendukung proses sertifikasi halal.<\/p>\n

 <\/p>\n

Mengenal Sumber dan Jenis DNA pada Hewan<\/strong><\/p>\n

Berdasarkan literasi agama Islam yang bersumber dari berbagai ayat di dalam Al-Quran dan beberapa hadis, diketahui bahwasanya zat-zat non-halal yang keberadaannya diharamkan untuk dikonsumsi dan menjadi landasan dalam proses sertifikasi halal serta bisa didekati dengan metode PCR ini diantaranya adalah babi dan hewan-hewan karnivora, bertaring serta berkuku tajam. Dari keterangan tersebut Kita ketahui bahwa hewan-hewan yang disebutkan di atas tergolong ke dalam hewan-hewan tingkat tinggi (red: tersusun atas sel-sel eukariota). Tahukah Anda bahwa hewan tingkat tinggi tersebut di dalam selnya mengandung 2 jenis DNA dari 2 sumber lokasi yang berbeda pula? Kedua DNA itu adalah DNA Nukleus (nDNA), yang bisa Kita temukan di dalam nucleus, dan DNA Mitokondia (mtDNA), yang bisa Kita temukan di dalam organel mitokondria.<\/p>\n

 <\/p>\n

Baca Juga:\u00a0<\/strong>Droplet Digital PCR (ddPCR\u2122) untuk Pengujian Patogen pada Air Limbah<\/a><\/p>\n

 <\/p>\n

\n
\n

DNA Nukelus atau dikenal juga dengan DNA Genomik merupakan DNA yang paling umum di dalam sel dan bisa Kita temukan pada inti sel atau nukleus. Di dalam nucleus itu sendiri, DNA dikemas menjadi bentuk kromosom. Kromosom ini berbentuk linear dan mengandung informasi genetik yang merupakan identas atau \u201cKTP\u201d alamiah bagi suatu spesies serta berfungsi dalam mengendalikan fungsi sel secara menyeluruh.<\/p>\n

Adapun sumber DNA lainnya di dalam sel bisa Kita temukan di organel yang dikenal sebagai organel penghasil energi bagi sel. Organel tersebut biasa disebut dengan nama mitokondria. DNA Mitokondria berbeda dari DNA Nukleus dalam hal ukuran, jumlah gen, dan bentuknya, serta memiliki laju mutasi yang lebih tinggi. Ukuran DNA Mitokondria cenderung lebh kecil dibandingkan dengan DNA Nukleus serta memiliki bentuk yang sirkuler. Olehkarena itu di dalam sel, keberadaan DNA mitokondria lebih banyak dibandingkan dengan DNA Nukleus.<\/p>\n<\/div>\n

\"\"<\/center>
\"\"<\/center>
\n
Gambar 2 Dua Jenis DNA dalam Tubuh Hewan: (a) DNA Nukleus, nDNA dan (b) DNA Mitokondria, mtDNA
\nSumber Gambar<\/i>\u00a0:https:\/\/news.amdi.usm.my\/fullarticle.php?id=SS<\/a> <\/p>\n

<\/center><\/div>\n<\/div>\n

 <\/p>\n

Perbandingan antara DNA Nukleus dan DNA Mitokondria bisa kita lihat lebih jelas pada Tabel 1 di bawah ini.<\/p>\n

 <\/p>\n

Tabel 1 Perbedaan Antara DNA Nukleus dengan DNA Mitokondria<\/p>\n

\"\"<\/center> <\/p>\n

Target DNA pada Metode PCR<\/strong><\/p>\n

Pada pembahasan sebelumnya (red: lihat kembali artikel\u00a0Pojok Halal Sciencewerke Jilid 1\u00a0<\/a>Kita sudah ketahui bersama bahwasanya target uji dari metode PCR adalah senyawa DNA. Dimana target DNA ini yang kemudian akan dideteksi oleh primer yang Bersifat spesifik dan kemudian akan diamplifikasi\/diperbanyak menjadi ribuan fragmen DNA spesifik yang identik, yang biasa dikenal dengan istilah amplikon. Amplikon ini yang kemudian akan dianalisa sesuai dengan jenis metode PCR yang digunakan.<\/p>\n

 <\/p>\n

\"\"<\/center>
Gambar 3 Digital PCR Instrument, QX600 Droplet Digital PCR System #17007769<\/center> <\/p>\n

Baca Juga:\u00a0<\/strong>Fenomena Stunting : Pendekatan Scientific dan Solusi Deteksi Dini Defisiensi Mikronutrien dengan Q-Plex Multiplex Immunoassay<\/a><\/p>\n

 <\/p>\n

Pada metode PCR konvensional, analisa amplikon dilakukan dengan bantuan elektroforesis gel. Analisa dilakukan berdasarkan ukuran amplikon yang dihasilkan. Analisa ini\u00a0besifat<\/i>\u00a0kualitatif, sehingga hasilnya adalah ada atau tidaknya DNA target di dalam sampel yang diujikan. Sedangkan pada metode\u00a0real-time<\/i>\u00a0PCR (qPCR), penggunaan penanda\/palacak membantu dalam proses analisa amplikon yang terbentuk. Penanda ini yang kemudian akan mengirimkan sinyal floresen kepada detektor pada instrumen qPCR. Sinyal tersebut bisa dianalisa sebagai hasil kualitatif maupun semi- kuantitatif bila kita menggunakan kurva standar\/pembanding dalam proses analisanya. Dengan konsep yang lebih maju dan sensitif, metode digital PCR (dPCR) dapat digunakan bukan hanya untuk kebutuhan analisis kualitatif saja akan tetapi juga bisa untuk melakukan analisa kuantitatif yang Bersifat absolut dikarenakan proses kuantifikasinya dilakukan tanpa menggunakan kurva standar\/pembanding.<\/p>\n

 <\/p>\n

Lalu pertanyaannya adalah DNA mana yang bisa Kita jadikan target DNA dalam metode PCR? DNA Nukleus atau DNA Mitokondria? Jawaban dari kedua pertanyaan tersebut adalah semua sampel DNA bisa Kita jadikan sebagai target DNA pada metode PCR kita. Mau kita menggunakan metode konvensional,\u00a0real-time,<\/i>\u00a0maupun digital PCR sekalipun. Selama keberadaan DNA tersebut bisa Kita peroleh dari sampel uji yang Kita gunakan, maka Kita bisa melakukan analisa menggunakan metode PCR. Tidak masalah bila itu DNA Nukleus ataupun DNA Mitokondria. Bahkan DNA sintetik sekalipun akan terdeteksi selama sesuai\/mengandung sekuen target dari primer yang Kita gunakan.<\/p>\n

Apa Kata SNI Kita Terkait Penggunaan DNA Nukleus dan DNA Mitokondria dalam Pengujian Halal\/Cemaran Babi?<\/strong><\/p>\n

Isu halal merupakan salah satu isu penting yang diatur oleh pemerintahan Indonesia salah satunya dikarenakan mayoritas masyarakat Kita adalah beragama Islam. Regulasi terkait halal sudah banyak dikeluarkan oleh BSN (Badan Standarisasi Nasional) dalam bentuk dokumen-dokumen SNI (Standar Nasional Indonesia). Dari definisi pangan halal, sistem manajemen halal, pemotongan halal pada hewan, hingga kepada metode deteksi etanol dan DNA babi sudah dikeluarkan oleh BSN.<\/p>\n

\n
\n

Oleh karena itu, \u201cpengujian halal\u201d atau lebih tepatnya kita sebut dengan pengujian cemaran\u00a0porcine\/<\/i>\u00a0babi telah memiliki dasar regulasi yang bisa digunakan oleh pihak- pihak yang berkepentingan untuk menjaga mutu dan kualitas hasil pengujiannya. Saat ini ada 2 (dua) SNI yang bersinggungan dengan pengujian cemaran babi menggunakan pendekatan DNA. Keduanya adalah SNI ISO\/TS 20224-3:2020 dan SNI 9278:2024.<\/p>\n

Lalu apa yang harus Kita gunakan sebagai target DNA Kita dalam pengujian cemaran babi menggunakan metode qPCR sesuai kedua SNI di atas? Apakah Kita harus menggunakan DNA Nukleus (nDNA) ataukah dengan menggunakan DNA Mitokondria (mtDNA)? Jika Kita pelajari secara seksama kedua SNI di atas, maka Kita akan ketahui bahwa baik DNA Nukleus maupun DNA Mitokondria sama-sama memiliki dasar dan dapat digunakan sebagai DNA target dalam pengujian cemaran\u00a0porcine<\/i>\/babi yang Kita lakukan sesuai dengan SNI yang berlaku di negara Indonesia.<\/p>\n<\/div>\n

\"\"<\/center>
Gambar 4 Logo SNI, Standar Nasional Indonesia
\nSumber Gambar:\u00a0https:\/\/id.wikipedia.org\/wiki\/Standar_Nasional_I ndonesia<\/a> <\/p>\n

<\/center><\/div>\n<\/div>\n

 <\/p>\n

Baca Juga:\u00a0<\/strong>Aplikasi Teknologi KASP Genotyping dalam Identifikasi SNPs<\/a><\/p>\n

 <\/p>\n

Pada SNI ISO\/TS 20224-3:2020 mengenai\u00a0Analisis biomarker molekuler – Deteksi bahan turunan hewan pada bahan pangan dan bahan pakan menggunakan real – time PCR – Bagian 3: Metode deteksi DNA babi,<\/i>\u00a0dijelaskan bahwa dalam SNI ini pengujian yang dilakukan menggunakan pasang primer yang menarget pada gen beta-aktin dari spesies\u00a0Sus scrofa.<\/i>\u00a0Gen beta-aktin ini sendiri terletak di dalam DNA yang berada pada nucleus, sehingga bisa Kita kategorikan sebagai DNA Nukleus (nDNA). Beta-aktin sendiri merupakan protein yang berperan dalam struktur dan pergerakan sel. Protein ini membentuk filamen aktin yang memberikan dukungan struktural dan memungkinkan pergerakan sel untuk dilakukan.<\/p>\n

 <\/p>\n

Sedangkan pada SNI 9278:2024 mengenai\u00a0Metode deteksi DNA spesifik babi pada produk pangan mengandung gelatin \u2014 Metode kualitatif real-time PCR menggunakan hydrolysis\u00a0Probe,<\/i>\u00a0dijelaskan bahwa pengujian yang dilakukan di SNI ini menggunakan pelacak floresen (red:\u00a0Probe<\/i>) yang menargetkan gen sitokrom b dari spesies\u00a0Sus scrofa<\/i>\u00a0yang merupakan DNA Mitokondria (mtDNA). Gen sitokrom b mengkode protein sitokrom b yang merupakan bagian dari komplek III dalam rantai transpor elektron di mitokondria.<\/p>\n

 <\/p>\n

Berdasarkan penjelasan di atas, maka Kita bisa ketahui bersama bahwa baik menggunakan target DNA Nukleus maupun target DNA Mitokondria sama-sama memiliki dasar\/landasan SNI yang bisa digunakan dalam pengujian cemaran\u00a0porcine<\/i>\/babi. Kita bisa mengikuti acuan SNI ISO \/TS 20224- 3:2020 ataupun SNI 9278:2024 dalam pemilihan target DNA yang ingin digunakan dalam pengujian. Sehingga apapun target DNA yang Kita gunakan, baik itu DNA Nukleus maupun DNA Mitokondria, selama itu bersumber dari target uji Kita (red: babi ataupun hewan yang diharamkan lainnya), maka bisa Kita gunakan dalam \u201cpengujian halal\u201d Kita.<\/p>\n

 <\/p>\n

Sekarang Waktunya Kita Kenalan sama Solusi dari Kami Terkait Target DNA dalam Pengujian Halal\/Cemaran Babi Yuk<\/strong><\/p>\n

Nah setelah membaca penjelasan di atas terkait target DNA yang bisa Kita gunakan dalam pengujian cemaran babi menggunakan metode PCR (red:\u00a0real-time<\/i>\u00a0PCR). Kami dari PT. Sciencewerke memiliki beragam solusi untuk Teman-Teman sekalian, baik yang tergabung ke dalam tim DNA Nukleus (nDNA) maupun tim DNA Mitokondria (mtDNA) nih.<\/p>\n

Buat Teman-Teman yang masuk ke dalam tim DNA Nukleus (nDNA) sebagai target uji pada pengujian cemaran babi menggunakan metode\u00a0real-time<\/i>\u00a0PCR (qPCR)nya, Kami memiliki solusi berupa\u00a0Paket Kit Homebrew HALAL ISO secara real-time PCR.<\/strong>\u00a0Kit ini menggunakan gen beta-aktin sebagai target deteksi primer dan\u00a0probe<\/i>-nya. Kit ini Kami siapkan menyesuaikan dengan aturan yang ada di SNI ISO\/TS 20224-3:2020. Di dalam paket kit ini Teman-Teman sudah bisa mendapatkan:<\/p>\n